chokolade allergi er mulige, selvom de er Rares. Det allergiske fænomen kommer i dette tilfælde fra kakaoens proteiner. Den allergiske person, der indtager det, oplever derefter vejrtrækningsbesvær, har hovedpine, udslæt, takykardi, kløe og en brændende fornemmelse i maven.

Disse symptomer kan også observeres hos mennesker, der er allergiske over for de elementer, der udgør chokolade (nødder, mælkeproteiner osv..), selvom de derfor ikke er allergiske over for kakao i sig selv.